00001
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00047
00048
00049
00050
00051
00052 #ifndef _SPMDI_H_
00053 #define _SPMDI_H_
00054
00055
00056
00057 template <class T>
00058 int linearSize(const T& inputT)
00059 {
00060 return inputT.linearSize();
00061 }
00062
00063 template <class T>
00064 void linearIn(T& a_outputT, const void* const inBuf)
00065 {
00066 a_outputT.linearIn(inBuf);
00067 }
00068
00069 template <class T>
00070 void linearOut(void* const a_outBuf, const T& inputT)
00071 {
00072 inputT.linearOut(a_outBuf);
00073 }
00074
00075 #ifdef MPI
00076
00077
00078
00079
00080 template <class T>
00081 inline void
00082 gather(Vector<T>& a_outVec, const T& a_input, int a_dest)
00083 {
00084 assert (a_dest >= 0);
00085 assert(a_dest < numProc());
00086
00087 int isize = linearSize(a_input);
00088
00089
00090 void* loclBuf = malloc(isize);
00091 if(loclBuf == NULL)
00092 MayDay::Error("out of memory in gather 1");
00093
00094
00095 linearOut(loclBuf, a_input);
00096
00097 int nProcess = numProc();
00098 int sendCount = 1;
00099 int recdCount = 1;
00100
00101
00102 int* vectSize = NULL;
00103 int* vectDisp = NULL;
00104 void* sendBuf = static_cast<void*>(&isize);
00105
00106 if(procID() == a_dest)
00107 {
00108 vectSize = new int[nProcess];
00109 vectDisp = new int[nProcess];
00110 }
00111
00112 int result1 = MPI_Gather(sendBuf, sendCount, MPI_INT,
00113 vectSize,recdCount, MPI_INT,
00114 a_dest, Chombo_MPI::comm);
00115
00116 if(result1 != MPI_SUCCESS)
00117 MayDay::Error("Gather<T> failed in MPI_Gather 1");
00118
00119
00120 void* recdBuf = NULL;
00121 if(procID() == a_dest)
00122 {
00123 int itotsize=0;
00124 for(int iproc = 0; iproc < nProcess; iproc++)
00125 {
00126 vectDisp[iproc] = itotsize;
00127 itotsize += vectSize[iproc];
00128 }
00129 recdBuf = malloc(itotsize);
00130 if(recdBuf == NULL)
00131 MayDay::Error("out of memory in gather 2");
00132 }
00133
00134
00135 int result2 = MPI_Gatherv(loclBuf, isize, MPI_BYTE,
00136 recdBuf, vectSize, vectDisp, MPI_BYTE,
00137 a_dest, Chombo_MPI::comm);
00138 if(result2 != MPI_SUCCESS)
00139 MayDay::Error("Gather<T> failed in MPI_Gather 2");
00140
00141 if(procID() == a_dest)
00142 {
00143
00144 int ioffset = 0;
00145 a_outVec.resize(nProcess);
00146
00147 char* arithPtr = (char*)recdBuf;
00148 for(int iproc = 0; iproc < nProcess; iproc++)
00149 {
00150 ioffset = vectDisp[iproc];
00151 char* thisProcBuf = arithPtr + ioffset;
00152 linearIn(a_outVec[iproc], thisProcBuf);
00153 }
00154
00155
00156 delete[] vectSize;
00157 delete[] vectDisp;
00158 free(recdBuf);
00159 }
00160
00161
00162 free(loclBuf);
00163 }
00164
00165
00166
00167
00168 template <class T>
00169 inline void
00170 broadcast(T& a_inAndOut, int a_src)
00171 {
00172 assert (a_src >= 0);
00173 assert(a_src < numProc());
00174 int isize;
00175 if(procID() == a_src)
00176 isize = linearSize(a_inAndOut);
00177
00178 MPI_Bcast(&isize, 1, MPI_INT, a_src, Chombo_MPI::comm);
00179
00180 void* broadBuf = malloc(isize);
00181
00182 if(broadBuf == NULL)
00183 MayDay::Error("out of memory in broadcast");
00184
00185
00186 if(procID() == a_src)
00187 linearOut(broadBuf, a_inAndOut);
00188
00189
00190 MPI_Bcast(broadBuf, isize, MPI_BYTE, a_src, Chombo_MPI::comm);
00191
00192
00193 if(procID() != a_src)
00194 linearIn(a_inAndOut, broadBuf);
00195
00196
00197 free(broadBuf);
00198 }
00199
00200
00201
00202
00203 inline void
00204 barrier(void)
00205 {
00206 MPI_Barrier(Chombo_MPI::comm);
00207 }
00208
00209 #else
00210
00211
00212
00213 template <class T>
00214 inline void
00215 gather(Vector<T>& a_outVec, const T& a_input, int a_dest)
00216 {
00217 a_outVec.resize(1);
00218 a_outVec[0] = a_input;
00219 }
00220
00221
00222
00223 template <class T>
00224 inline void
00225 broadcast(T& a_inAndOut, int a_src)
00226 {
00227
00228 }
00229
00230
00231
00232 inline void
00233 barrier(void)
00234 {
00235
00236 }
00237
00238 #endif //the mpi thing
00239
00240
00241
00242
00243
00244
00245 template <class T>
00246 void
00247 linearListIn(Vector<T>& a_outputT, const void* const a_inBuf)
00248 {
00249
00250 const int* const intBuf = (int*)a_inBuf;
00251 int vecsize = intBuf[0];
00252 Vector<int> vecOffset(vecsize);
00253
00254 for(int ivec = 0; ivec < vecsize; ivec++)
00255 {
00256 vecOffset[ivec] = intBuf[ivec+1];
00257 }
00258
00259
00260
00261
00262
00263
00264 a_outputT.resize(vecsize);
00265 const char* const charbuf = (char*)a_inBuf;
00266 for(int ivec = 0; ivec < vecsize; ivec++)
00267 {
00268 const char* const dataLoc = charbuf + vecOffset[ivec];
00269 linearIn(a_outputT[ivec], dataLoc);
00270 }
00271 }
00272
00273
00274 template <class T>
00275 void
00276 linearListOut(void* const a_outBuf, const Vector<T>& a_input)
00277 {
00278
00279 int* const intBuf = (int*)a_outBuf;
00280 intBuf[0] = a_input.size();
00281 int vecsize = intBuf[0];
00282 Vector<int> vecOffset(vecsize);
00283
00284
00285 int ioffset = (vecsize+1)*sizeof(int);
00286 for(int ivec = 0; ivec < vecsize; ivec++)
00287 {
00288 intBuf[ivec+1] = ioffset;
00289 vecOffset[ivec] = ioffset;
00290 ioffset += linearSize(a_input[ivec]);
00291 }
00292
00293
00294
00295
00296
00297 char* const charBuf = (char*)a_outBuf;
00298 for(int ivec = 0; ivec < vecsize; ivec++)
00299 {
00300 char* const dataLoc = charBuf + vecOffset[ivec];
00301 linearOut(dataLoc, a_input[ivec]);
00302 }
00303 }
00304
00305
00306 template <class T>
00307 int
00308 linearListSize(const Vector<T>& a_input)
00309 {
00310
00311
00312
00313 int itotsize = (a_input.size() + 1)*sizeof(int);
00314 for(int ivec = 0; ivec < a_input.size(); ivec++)
00315 {
00316 itotsize += linearSize(a_input[ivec]);
00317 }
00318 return itotsize;
00319 }
00320
00321 #endif