- a -

• Abort() : MayDay
• abs() : FArrayBox
• accumulate() : DerivStencil
• add() : PP_List< T >, List< T >, Callbacks
• addAfter() : PP_List< T >, List< T >
• addBefore() : PP_List< T >, List< T >
• addBox() : BoxLayout
• addDefn() : ParmParse
• advance() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• aliasAddBox() : BoxLayout
• aliasClose() : BoxLayout
• AliasDataFactory() : AliasDataFactory< T >
• align() : Arena
• allDefined() : AMRLevelSelfGravity
• alloc() : CArena, BArena, Arena
• allocateBuffers() : BoxLayoutData< T >
• allocateGhostVector() : BoxLayoutData< T >
• AMR() : AMR
• AMRLevel() : AMRLevel< TTYPE >
• AMRLevelMG() : AMRLevelMG, AMRSolver
• AMRLevelSelfGravity() : AMRLevelSelfGravity
• AMRLevelSelfGravityFactory() : AMRLevelSelfGravityFactory
• AMRSolver() : AMRSolver, AMRLevelMG
• AMRVCycleMG() : AMRSolver
• and_box() : IntVectSet
• and_domain() : IntVectSet
• and_intvectset() : IntVectSet
• any() : IndexType
• append() : Vector< T >, PP_List< T >, List< T >
• apply() : LevelData< T >, BoxLayoutData< T >
• applyAMROperator() : AMRSolver, AMRLevelMG
• applyAMROperatorHphys() : AMRSolver, AMRLevelMG
• applyBCs() : BoxGhostBC
• applyExtrapBCs() : ExtrapBC
• applyFlattening() : GodunovUtilities
• applyHOExtrapBCs() : HOExtrapBC
• applyHomogeneousBCs() : HOExtrapBC, DomainGhostBC, BoxGhostBC, ExtrapBC
• applyInhomogeneousBCs() : HOExtrapBC, DomainGhostBC, BoxGhostBC, ExtrapBC
• applyOpH() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, GradDivOp
• applyOpHcfIphys() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, GradDivOp
• applyOpI() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, GradDivOp
• applyOpIcfHphys() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, GradDivOp
• applySource() : SelfGravityPhysics
• Arena() : Arena
• ArrayViewData() : ArrayViewData, LayoutData< T >
• artificialViscosity() : GodunovUtilities
• artViscBC() : PhysIBC, TestsIBC, RampIBC, CodeTestsIBC
• assign() : Vector< T >
• assignDt() : AMR
• averageGridData() : CoarseAverage
• averageToCoarse() : CoarseAverage

- b -

• back() : Vector< T >
• BArena() : BArena
• BaseBottomSmoother() : BaseBottomSmoother
• BaseFab() : BaseFab< T >
• BaseHelmholtzOp() : BaseHelmholtzOp
• begin() : TreeIntVectSetIterator, ShiftIterator, SideIterator, ListIterator< T >, LayoutIterator, IVSIterator, Interval, DenseIntVectSetIterator, BoxIterator, BitSetIterator
• BiCGStabSmoother() : BiCGStabSmoother
• bigEnd() : Box, BaseFab< T >
• BitSet() : BitSet
• BitSetIterator() : BitSetIterator, BitSet
• bldTable() : ParmParse
• block() : CArena::Node
• blockFactor() : AMR, MeshRefine
• bottomSmoother() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp
• Box() : Box, IntVect
• box() : NodeFArrayBox, LayoutData< T >, FluxBox, DenseIntVectSet, BaseFab< T >, Entry
• boxes() : AMRLevel< TTYPE >, IntVectSet
• BoxGhostBC() : BoxGhostBC
• BoxIterator() : BoxIterator
• BoxLayout() : BoxLayout, LayoutIterator, DataIterator, DataIndex, LayoutIndex
• boxLayout() : LayoutData< T >
• BoxLayoutData() : BoxLayoutData< T >
• breakBoxes() : BRMeshRefine
• BRMeshRefine() : BRMeshRefine
• bufferAllocated() : Copier
• bufferSize() : MeshRefine
• bulkModulusIndex() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics

- c -

• c_str() : PP_String
• callDelete() : DataFactory< T >
• calloc() : CArena
• capacity() : Vector< T >
• CArena() : CArena
• catenate() : PP_List< T >, List< T >
• cellCentered() : Box, IndexType
• CFInterp() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, GradDivOp
• CFIVS() : CFIVS
• CFStencil() : CFStencil
• charAnalysis() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• charSynthesis() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• charValues() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• check() : Copier, BoxLayout
• checkDomains() : DisjointBoxLayout
• checkPeriodic() : DisjointBoxLayout
• checkpointInterval() : AMR
• checkpointPrefix() : AMR
• chfptr() : chfptr
• chop() : TreeIntVectSet, IntVectSet, DenseIntVectSet, Box
• clear() : AMRSolver, TensorCFInterp, QuadCFInterp, DerivStencil, CornerCopier, CFStencil, Vector< T >, TreeIntVectSetIterator, TreeIntVectSet, Pool, PP_Array< T >, PP_List< T >, List< T >, IVSFAB< T >, FluxBox, Copier, Chombo::Timer, IndexType, BaseFab< T >, Timer
• clearMemory() : AMR, LevelSolver, LevelMG, AMRLevelMG
• close() : DisjointBoxLayout, BoxLayout
• CoarseAverage() : CoarseAverage
• coarseFineInterp() : TensorCFInterp, QuadCFInterp
• coarseFineInterpH() : TensorCFInterp
• coarsen() : TreeIntVectSet, ProblemDomain, IntVectSet, IntVect, DisjointBoxLayout, DenseIntVectSet, BoxLayout, Box
• coarsenable() : BoxLayout
• CodeTestsIBC() : CodeTestsIBC
• CodeUnits() : CodeUnits
• compact() : TreeIntVectSet, IntVectSet, DenseIntVectSet
• completePendingSends() : BoxLayoutData< T >
• computeAMRResidual() : AMRSolver, AMRLevelMG
• computeAMRResidualHphys() : AMRLevelMG
• computeBoxLen() : Box
• computeBoxLenNotEmpty() : Box
• computeDt() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• computeFaceDiv() : GradDivOp
• computeFaceDivH() : GradDivOp
• computeFirstDerivative() : QuadCFStencil
• computeFlattening() : GodunovUtilities
• computeFluxes() : PatchGodunov
• computeForce() : AMRLevelSelfGravity
• computeInitialDt() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• computeLocalBlockFactors() : MeshRefine
• computeMixedDerivative() : QuadCFStencil
• computeNorm() : AMRSolver, AMRLevelMG
• computeResidualNorm() : AMRSolver, AMRLevelMG
• computeSecondDerivative() : QuadCFStencil
• computeShifts() : ShiftIterator
• computeSlopes() : PiecewiseLinearFillPatch, PiecewiseLinearFillPatchFace
• computeTanGrad() : TensorCFInterp
• computeUpdate() : PatchGodunov, LevelGodunov
• computeWHalf() : PatchGodunov, LevelGodunov
• conclude() : AMR
• consToPrim() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• contains() : TreeIntVectSet, ProblemDomain, ParmParse, IntVectSet, Interval, DenseIntVectSet, Box, BaseFab< T >
• contains_box() : ProblemDomain, IntVectSet
• contains_intvectset() : IntVectSet
• convert() : IntVectSet, Box
• Copier() : Copier, DisjointBoxLayout, DataIndex
• copy() : NodeFArrayBox, List< T >, IVSFAB< T >, IntVectSet, IntVect, FluxBox, Box, BaseFab< T >
• CopyIterator() : CopyIterator, Copier
• copyModify() : PP_String
• copyTo() : LevelData< T >
• CornerCopier() : CornerCopier
• Count() : Chombo::Timer, Timer, CounterStruct
• countname() : ParmParse
• countval() : ParmParse
• create() : DefaultDataFactory< T >, AliasDataFactory< T >, FABAliasDataFactory, DefaultDataFactory< T >, DataFactory< T >
• createBoxes() : TreeIntVectSet, DenseIntVectSet

- d -

• DataIndex() : DataIndex, LayoutIndex
• DataIterator() : DataIterator, DataIndex, LayoutIndex, BoxLayout
• dataIterator() : LayoutData< T >, BoxLayout
• dataPtr() : RealVect, PP_Array< T >, IVSFAB< T >, IntVect, BaseFab< T >
• deepCopy() : DisjointBoxLayout, BoxLayout
• define() : PhysIBC, PatchGodunov, LevelGodunov, GodunovUtilities, GodunovPhysics, AMRLevel< TTYPE >, AMR, TensorOp, PoissonOp, MGInterp, LevelSolver, LevelOp, LevelMG, HelmholtzOp, GradDivOp, BoxGhostBC, AMRSolver, AMRLevelMG, TensorFineStencilSet, TensorCFIVS, TensorCFInterp, QuadCFStencil, QuadCFInterp, PiecewiseLinearFillPatch, LevelFluxRegister, FineInterp, ExtrapFillPatch, DerivStencil, CornerCopier, CoarseAverage, CFStencil, CFIVS, TreeIntVectSetIterator, TreeIntVectSet, ProblemDomain, ParmParse, NodeFArrayBox, MeshRefine, LevelData< T >, LayoutData< T >, IVSFAB< T >, IVSIterator, IntVectSet, Interval, FluxBox, FArrayBox, DisjointBoxLayout, DenseIntVectSetIterator, Copier, BRMeshRefine, BoxLayoutData< T >, AliasDataFactory< T >, FABAliasDataFactory, BoxLayout, BoxIterator, Box, BitSet, BaseFab< T >, RefCellTagger, PiecewiseLinearFillPatchFace, CodeUnits, AMRLevelSelfGravityFactory, AMRLevelSelfGravity
• define_box() : IntVectSet
• define_intvect() : IntVectSet
• define_intvectset() : IntVectSet
• define_pd() : DisjointBoxLayout
• defineParams() : AMRLevelSelfGravity
• DenseIntVectSet() : DenseIntVectSet
• DenseIntVectSetIterator() : DenseIntVectSetIterator, DenseIntVectSet
• densityIndex() : SelfGravityPhysics
• DerivStencil() : DerivStencil
• diagShift() : IntVect
• DirichletBC() : DirichletBC
• DisjointBoxLayout() : DisjointBoxLayout, DataIterator
• disjointBoxLayout() : LevelData< T >
• divide() : FArrayBox
• divVel() : GodunovUtilities
• doBottomSmooth() : NoOpSmoother, GSRBSmoother, BiCGStabSmoother, BaseBottomSmoother
• domainBox() : ProblemDomain
• DomainGhostBC() : DomainGhostBC, DirichletBC, NeumannBC, HOExtrapBC, BoxGhostBC, ExtrapBC, GaussBC
• dotProduct() : RealVect, FArrayBox
• downSweep() : AMRLevelMG
• dt() : AMRLevel< TTYPE >
• dtToleranceFactor() : AMR
• dumpOn() : ProblemDomain, IntVect, Box
• dumpTable() : ParmParse
• dustCollapse() : CodeTestsIBC

- e -

• enclosedCells() : Box
• enclosedCells_int() : Box
• end() : TreeIntVectSetIterator, ShiftIterator, LayoutIterator, IVSIterator, Interval, DenseIntVectSetIterator, BitSetIterator
• entropyIndex() : SelfGravityPhysics
• Entry() : Entry
• eq() : LayoutIndex, BoxLayout, Box
• Error() : MayDay
• exchange() : LevelData< T >
• ExtrapBC() : ExtrapBC
• ExtrapFillPatch() : ExtrapFillPatch

- f -

• FABAliasDataFactory() : FABAliasDataFactory
• FArrayBox() : FArrayBox
• fillBCValues() : NeumannBC, HOExtrapBC, BoxGhostBC, ExtrapBC, GaussBC
• fillConstantInterp() : PiecewiseLinearFillPatch, PiecewiseLinearFillPatchFace
• fillExtrap() : ExtrapFillPatch
• fillInterp() : PiecewiseLinearFillPatch, PiecewiseLinearFillPatchFace
• fillRatio() : AMR, MeshRefine
• findMaxInflectionPoint() : BRMeshRefine
• findSplit() : BRMeshRefine
• FineInterp() : FineInterp
• finerLevelPtr() : AMRLevel< TTYPE >
• first() : PP_List< T >, List< T >
• firstElement() : PP_List< T >, List< T >
• fixedDt() : AMR
• flip() : Side, IndexType
• FluxBox() : FluxBox
• forceCorrection() : SelfGravityPhysics
• FourPtsGradient() : FourPtsGradient
• fourthOrderSlopes() : GodunovUtilities
• free() : CArena, BArena, Arena

- g -

• GaussBC() : GaussBC
• generalCopyTo() : BoxLayoutData< T >
• get() : ParmParse, PP_Array< T >, FArrayBox, BoxLayout
• getAMRLevels() : AMR
• getarr() : ParmParse
• getBackwardStencilSet() : TensorFineStencilSet
• getBoxes() : LevelData< T >
• getCenteredStencilSet() : TensorFineStencilSet
• getCoarIVS() : QuadCFStencil, CFStencil
• getCoarserLevel() : AMRLevelSelfGravity
• getCorr() : AMRSolver
• getCurrentTime() : AMR
• getFab() : NodeFArrayBox
• getFineIVS() : TensorCFIVS, QuadCFStencil, CFStencil, CFIVS
• getFinerLevel() : AMRLevelSelfGravity
• getFlux() : GodunovPhysics, TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, GradDivOp, FluxBox, SelfGravityPhysics
• getForwardStencilSet() : TensorFineStencilSet
• getGodunovPhysicsPtr() : PatchGodunov, LevelGodunov
• getIndex() : DerivStencil, IVSFAB< T >
• getIVS() : IVSFAB< T >
• getline() : PP_String
• getMaxWaveSpeed() : LevelGodunov, GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• getMaxWaveSpeedWithSource() : SelfGravityPhysics
• getPhi() : AMRLevelSelfGravity
• getPhiStar() : TensorCFInterp, QuadCFInterp
• getPhysIBC() : GodunovPhysics
• getPoissonRhs() : AMRLevelSelfGravity
• getPtr() : Pool
• getResid() : AMRSolver
• getStateNew() : AMRLevelSelfGravity
• getStateOld() : AMRLevelSelfGravity
• getTanGrad() : TensorOp, GradDivOp
• getTimeStampWC() : Chombo::Timer, Timer
• getToken() : ParmParse
• getval() : ParmParse
• getVal() : BaseFab< T >
• getVect() : IntVect, Box
• getWeight() : DerivStencil
• ghostDefine() : Copier
• ghostVect() : LevelData< T >
• GodunovPhysics() : GodunovPhysics
• GodunovUtilities() : GodunovUtilities
• GradDivOp() : GradDivOp
• Gradient() : Gradient
• gradient() : TenPtsGradient, FourPtsGradient, TwoPtsGradient, Gradient
• granularity() : MeshRefine
• gravity() : AMRLevelSelfGravity
• gridBufferSize() : AMR
• grow() : TreeIntVectSet, ProblemDomain, IntVectSet, DenseIntVectSet, Box
• grow_dir() : IntVectSet
• growDir() : Box
• growHi() : ProblemDomain, Box
• growLo() : ProblemDomain, Box
• GSRBSmoother() : GSRBSmoother

- h -

• heliumMassFraction() : CodeUnits
• HelmholtzOp() : HelmholtzOp
• hiVect() : IVSFAB< T >, Box, BaseFab< T >
• HOExtrapBC() : HOExtrapBC
• homogeneousCFInterp() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, GradDivOp
• homogeneousCFInterpPhi() : TensorOp
• homogeneousCFInterpTanGrad() : TensorOp, GradDivOp
• homogeneousCFInterpU() : GradDivOp
• hydrogenMassFraction() : CodeUnits

- i -

• i() : ShiftIterator, LayoutIterator, DataIterator, chfptr
• image() : ProblemDomain
• includes() : PP_List< T >, List< T >
• incr() : ShiftIterator, LayoutIterator, IVSIterator
• incrementCoarse() : LevelFluxRegister
• incrementFine() : LevelFluxRegister
• incrementFRFine() : AMRLevelMG
• incrementLinearInterp() : PiecewiseLinearFillPatch
• incrementLinearInterpNormal() : PiecewiseLinearFillPatchFace
• incrementLinearInterpTangential() : PiecewiseLinearFillPatchFace
• incrementSource() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• index() : BoxLayout, Box, Entry
• IndexType() : IndexType
• initFRCoarse() : AMRLevelMG
• initialData() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• initialDtMultiplier() : AMRLevel< TTYPE >
• initialGrid() : AMRLevel< TTYPE >, AMR, AMRLevelSelfGravity
• initialize() : PhysIBC, BitSet, TestsIBC, RampIBC, CodeTestsIBC
• initialTime() : AMR
• InitStatics() : IntVect
• intCode() : LayoutIndex
• interpGridData() : FineInterp
• interpOnIVS() : TensorCFInterp, QuadCFInterp
• interpToFine() : MGInterp, FineInterp
• intersects() : ProblemDomain, Box
• intersectsNotEmpty() : ProblemDomain, Box
• interval() : BoxLayoutData< T >, BaseFab< T >
• Interval() : Interval
• IntVect() : IntVect
• IntVectSet() : IntVectSet, TreeIntVectSet
• invert() : FArrayBox
• isBCDefined() : DomainGhostBC
• isBool() : ParmParse
• isClosed() : BoxLayout
• isDefined() : PatchGodunov, GodunovPhysics, AMRLevel< TTYPE >, AMR, TensorOp, PoissonOp, MGInterp, LevelSolver, LevelOp, LevelMG, HelmholtzOp, GradDivOp, AMRSolver, AMRLevelMG, TensorFineStencilSet, TensorCFIVS, TensorCFInterp, QuadCFStencil, QuadCFInterp, PiecewiseLinearFillPatch, LevelFluxRegister, FineInterp, ExtrapFillPatch, DerivStencil, CoarseAverage, CFStencil, CFIVS, MeshRefine, IVSFAB< T >, BoxLayoutData< T >, SelfGravityPhysics, PiecewiseLinearFillPatchFace, CodeUnits, AMRLevelSelfGravityFactory
• isDense() : IntVectSet
• isDisjoint() : DisjointBoxLayout
• isDouble() : ParmParse
• isEmpty() : TensorFineStencilSet, QuadCFStencil, CFStencil, TreeIntVectSet, ProblemDomain, PP_List< T >, List< T >, IntVectSet, DenseIntVectSet, Box, BitSet
• isFull() : DenseIntVectSet, BitSet
• isInteger() : ParmParse
• isNonUnique() : RefCountedPtr< T >
• isNotEmpty() : PP_List< T >, List< T >
• isNull() : RefCountedPtr< T >, PP_String, PP_LnPtr< T >, PP_CpPtr< T >, LayoutIndex
• isPacked() : CFIVS
• isPeriodic() : ProblemDomain
• isSetUp() : AMR
• isSorted() : BoxLayout
• isThisFinestLev() : AMRLevelSelfGravity
• isUnsigned() : ParmParse
• iv() : IVSIterator
• IVSFAB() : IVSFAB< T >
• IVSIterator() : IVSIterator, IntVectSet
• ixType() : Box, IndexType

- j -

• join() : PP_List< T >, List< T >

- l -

• last() : PP_List< T >, List< T >
• lastElement() : PP_List< T >, List< T >
• LayoutData() : LayoutData< T >
• LayoutIndex() : LayoutIndex
• LayoutIterator() : LayoutIterator, DataIndex, LayoutIndex, BoxLayout
• layoutIterator() : BoxLayout
• lCoarsePtr() : LevelMG
• length() : PP_Array< T >, PP_List< T >, PP_String, List< T >, CodeUnits
• LevelData() : LevelData< T >
• LevelFluxRegister() : LevelFluxRegister
• LevelGodunov() : LevelGodunov
• levelGSMC() : PoissonOp
• LevelMG() : LevelMG
• LevelOp() : LevelOp
• levelOpPtr() : LevelMG, AMRLevelMG
• levelPreconditioner() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp
• levelSetup() : AMRLevelSelfGravity
• levelSolve() : LevelSolver
• levelSolveH() : LevelSolver
• LevelSolver() : LevelSolver
• lexGT() : RealVect, IntVect
• lexLT() : RealVect, IntVect
• linearIn() : TreeIntVectSet, NodeFArrayBox, IVSFAB< T >, IntVectSet, FluxBox, DenseIntVectSet, LDOperator< T >, BitSet, BaseFab< T >
• linearOut() : TreeIntVectSet, NodeFArrayBox, IVSFAB< T >, IntVectSet, FluxBox, DenseIntVectSet, LDOperator< T >, BitSet, BaseFab< T >
• linearSize() : TreeIntVectSet, NodeFArrayBox, IntVectSet, DenseIntVectSet, BitSet
• linkCount() : PP_LnPtr< T >, PP_UseCount
• List() : List< T >
• listIterator() : List< T >
• ListIterator() : ListIterator< T >
• loadBalance() : AMRLevelSelfGravity
• longside() : Box
• loVect() : IVSFAB< T >, Box, BaseFab< T >
• lt() : Box

- m -

• makeBaseLevelMesh() : AMR
• makeBoxes() : MeshRefine, BRMeshRefine
• makeBoxesParallel() : BRMeshRefine
• makeEmpty() : IntVectSet
• makeItSo() : BoxLayoutData< T >
• makePNDs() : MeshRefine
• makePoissonRhs() : AMRLevelSelfGravity
• makeTrace() : BRMeshRefine
• makeTraces() : BRMeshRefine
• maskEQ() : FArrayBox
• maskGE() : FArrayBox
• maskGT() : FArrayBox
• maskLE() : FArrayBox
• maskLT() : FArrayBox
• massDensity() : CodeUnits
• max() : IntVect, FArrayBox
• maxBaseGridSize() : AMR
• maxDtGrow() : AMR
• maxGridSize() : AMR
• maxIndex() : FArrayBox
• maxloc() : BRMeshRefine
• maxSize() : MeshRefine
• mBox() : DenseIntVectSet
• memUsage() : Pool
• mergeBoxes() : MergeBoxesOnLines
• MergeBoxesOnLines() : MergeBoxesOnLines
• MeshRefine() : MeshRefine
• mflops() : Timer
• MGInterp() : MGInterp
• mgRelax() : LevelMG
• min() : IntVect, FArrayBox
• minBox() : TreeIntVectSet, IntVectSet, Box
• minIndex() : FArrayBox
• minus() : IntVectSet, FArrayBox
• minus_box() : IntVectSet
• minus_intvect() : IntVectSet
• MotionItem() : MotionItem
• mult() : FArrayBox

- n -

• Name() : Chombo::Timer, Timer, CounterStruct
• name() : BaseFab< T >
• nComp() : IVSFAB< T >, FluxBox, BoxLayoutData< T >, BaseFab< T >
• nCompPtr() : BaseFab< T >
• needGhostCells() : RefCellTagger
• needToRegrid() : AMR
• negate() : FluxBox, FArrayBox
• neq() : Box
• nestingRegion() : TreeIntVectSet, IntVectSet, DenseIntVectSet
• nestingRegion_prob() : IntVectSet
• NeumannBC() : NeumannBC
• new_amrlevel() : AMRLevelFactory, AMRLevelSelfGravityFactory
• new_bottomSmoother() : NoOpSmoother, GSRBSmoother, BiCGStabSmoother, BaseBottomSmoother
• new_boxghostbc() : NeumannBC, HOExtrapBC, BoxGhostBC, ExtrapBC, GaussBC
• new_godunovPhysics() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• new_levelop() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp
• new_physIBC() : PhysIBC, TestsIBC, RampIBC, CodeTestsIBC
• new_refCellTagger() : RefCellTagger
• next() : SideIterator, BoxIterator, Box
• Node() : CArena::Node
• nodeCentered() : IndexType
• NodeFArrayBox() : NodeFArrayBox
• NoOpSmoother() : NoOpSmoother
• norm() : FArrayBox
• numBoxes() : BoxLayout
• numConserved() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• numDensityHelium() : CodeUnits
• numDensityHydrogen() : CodeUnits
• numFluxes() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• numFromCellsToCopy() : Copier
• numIvs() : IVSFAB< T >
• numLocalCellsToCopy() : Copier
• numPrimitives() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• numPts() : TreeIntVectSet, IntVectSet, DenseIntVectSet, Box
• numPtsOK() : Box
• numSlopes() : SelfGravityPhysics
• numSmooth() : GSRBSmoother
• numToCellsToCopy() : Copier

- o -

• ok() : TreeIntVectSetIterator, ShiftIterator, SideIterator, ListIterator< T >, LayoutIterator, IVSIterator, DenseIntVectSetIterator, CopyIterator, BoxIterator, IndexType, BitSetIterator
• oneSidedDifferences() : GodunovUtilities
• op() : LDOperator< T >
• operator &() : ProblemDomain, IntVectSet, Box
• operator &=() : TreeIntVectSet, ProblemDomain, IntVectSet, DenseIntVectSet, Box
• operator *() : RefCountedPtr< T >, RealVect, PP_ListIterator< T >, PP_LnPtr< T >, PP_CpPtr< T >, ListIterator< T >, IntVect
• operator *=() : DerivStencil, RealVect, IntVect, FluxBox, FArrayBox
• operator bool() : ListIterator< T >
• operator const int *() : chfptr
• operator const T *() : Tuple< T, N >, RefCountedPtr< T >
• operator void *() : PP_ListIterator< T >
• operator!() : PP_ListIterator< T >, ListIterator< T >
• operator!=() : RealVect, PP_Array< T >, PP_List< T >, PP_ListIterator< T >, PP_String, PP_LnPtr< T >, PP_CpPtr< T >, List< T >, ListIterator< T >, IntVect, LayoutIndex, Box, IndexType
• operator()() : DomainGhostBC, TreeIntVectSetIterator, ShiftIterator, PP_ListIterator< T >, SideIterator, ListIterator< T >, LayoutIterator, IVSFAB< T >, IVSIterator, DenseIntVectSetIterator, DataIterator, CopyIterator, BoxIterator, BitSetIterator, BaseFab< T >
• operator+() : RealVect, IntVect, Box
• operator++() : TreeIntVectSetIterator, ShiftIterator, PP_ListIterator< T >, SideIterator, ListIterator< T >, LayoutIterator, IVSIterator, DenseIntVectSetIterator, CopyIterator, BoxIterator, BitSetIterator
• operator+=() : DerivStencil, RealVect, PP_String, IntVect, FluxBox, FArrayBox, Box
• operator-() : RealVect, IntVectSet, IntVect, Box
• operator--() : PP_ListIterator< T >, ListIterator< T >
• operator-=() : DerivStencil, TreeIntVectSet, RealVect, IntVectSet, IntVect, FluxBox, FArrayBox, DenseIntVectSet, Box
• operator->() : RefCountedPtr< T >, PP_LnClassPtr< T >, PP_CpClassPtr< T >
• operator/() : RealVect, IntVect
• operator/=() : DerivStencil, RealVect, IntVect, FArrayBox
• operator<() : TreeIntVectSet, RealVect, PP_String, IntVectSet, IntVect, DenseIntVectSet, Entry, Box, IndexType, BitSet, CArena::Node
• operator<=() : RealVect, PP_String, IntVect
• operator=() : DomainGhostBC, DerivStencil, CFStencil, Vector< T >, Tuple< T, N >, TreeIntVectSet, RefCountedPtr< T >, RealVect, ProblemDomain, ShiftIterator, PP_Array< T >, PP_List< T >, PP_String, PP_LnClassPtr< T >, PP_LnPtr< T >, PP_CpClassPtr< T >, PP_CpPtr< T >, PP_UseCount, List< T >, IntVect, BoxLayout, Box, IndexType, BitSet, CArena::Node, CodeUnits
• operator==() : TreeIntVectSet, RealVect, ProblemDomain, PP_Array< T >, PP_List< T >, PP_ListIterator< T >, PP_String, PP_LnPtr< T >, PP_CpPtr< T >, List< T >, ListIterator< T >, IntVectSet, IntVect, DenseIntVectSet, LayoutIndex, BoxLayout, Box, IndexType, CArena::Node
• operator>() : RealVect, PP_String, IntVect
• operator>=() : RealVect, PP_String, IntVect
• operator[]() : Vector< T >, Tuple< T, N >, RealVect, PP_Array< T >, PP_List< T >, PP_String, List< T >, LayoutData< T >, IntVect, FluxBox, DenseIntVectSet, BoxLayout, IndexType, BitSet, ArrayViewData
• operator|=() : TreeIntVectSet, IntVectSet, DenseIntVectSet
• or_box() : IntVectSet
• or_intvect() : IntVectSet
• or_intvectset() : IntVectSet

- p -

• p() : IntVectSet, IntVect, BoxLayout, Box, PP_ListIterator< T >, ListIterator< T >, Arena::Word
• packedBox() : CFIVS
• ParmParse() : ParmParse, PP_entry
• PatchGodunov() : PatchGodunov
• performCopy() : FArrayBox, BaseFab< T >
• performSetVal() : BaseFab< T >
• physDomain() : DisjointBoxLayout
• PhysIBC() : PhysIBC
• PiecewiseLinearFillPatch() : PiecewiseLinearFillPatch
• PiecewiseLinearFillPatchFace() : PiecewiseLinearFillPatchFace
• PLMNormalPred() : PatchGodunov, GodunovUtilities
• plotInterval() : AMR
• plotNames() : SelfGravityPhysics
• plotPrefix() : AMR
• plus() : FArrayBox
• plus_real() : FArrayBox
• PoissonOp() : PoissonOp
• Pool() : Pool
• postElliptic() : AMRLevelSelfGravity
• postInitialize() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• postNormalPred() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• postReceivesToMe() : BoxLayoutData< T >
• postRegrid() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• postSendsFromMe() : BoxLayoutData< T >
• postTimeStep() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• poutCoarseRegisters() : LevelFluxRegister
• poutFineRegisters() : LevelFluxRegister
• PP_Array() : PP_Array< T >
• PP_CpClassPtr() : PP_CpClassPtr< T >
• PP_CpPtr() : PP_CpPtr< T >
• PP_List() : PP_List< T >
• PP_ListIterator() : PP_ListIterator< T >
• PP_LnClassPtr() : PP_LnClassPtr< T >
• PP_LnPtr() : PP_LnPtr< T >
• PP_String() : PP_String, PP_StringRep
• PP_StringRep() : PP_StringRep
• PP_UseCount() : PP_UseCount
• ppindex() : ParmParse
• ppinit() : ParmParse
• PPMFaceValues() : GodunovUtilities
• PPMLimiter() : GodunovUtilities
• PPMNormalPred() : PatchGodunov, GodunovUtilities
• preAllocatable() : NodeFArrayBox, IVSFAB< T >, FluxBox, BaseFab< T >
• prepend() : PP_List< T >, List< T >
• pressure() : CodeUnits
• pressureIndex() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• primBC() : PhysIBC, TestsIBC, RampIBC, CodeTestsIBC
• print() : Copier, BoxLayout
• printBoxes() : IntVectSet
• printIntVectSets() : PiecewiseLinearFillPatch, PiecewiseLinearFillPatchFace
• printOn() : IntVect
• ProblemDomain() : ProblemDomain
• problemDomain() : AMRLevel< TTYPE >
• procID() : BoxLayout, MotionItem
• product() : RealVect, IntVect
• push_back() : Vector< T >

- q -

• QuadCFInterp() : QuadCFInterp
• QuadCFStencil() : QuadCFStencil
• quasilinearUpdate() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• query() : ParmParse
• queryarr() : ParmParse
• queryval() : ParmParse

- r -

• RampIBC() : RampIBC
• read_file() : ParmParse
• ready() : PP_Array< T >
• realloc() : CArena
• RealVect() : RealVect
• recalcMinBox() : TreeIntVectSet, IntVectSet, DenseIntVectSet
• receiveBoxesParallel() : BRMeshRefine
• RefCellTagger() : RefCellTagger
• refCount() : RefCountedPtr< T >
• RefCountedPtr() : RefCountedPtr< T >
• refine() : TreeIntVectSet, ProblemDomain, IntVectSet, DisjointBoxLayout, DenseIntVectSet, BoxLayout, Box
• refineGradient() : RefCellTagger
• refineJeans() : RefCellTagger
• refineOverdense() : RefCellTagger
• refineRegion() : RefCellTagger
• refineShocks() : RefCellTagger
• refineVorticity() : RefCellTagger
• reflect() : IntVect
• reflux() : AMRLevelMG, LevelFluxRegister
• refRatio() : AMRLevel< TTYPE >
• refRatios() : MeshRefine
• regrid() : AMRLevel< TTYPE >, AMR, MeshRefine, AMRLevelSelfGravity
• regridIntervals() : AMR
• relativeGradient() : RefCellTagger
• release() : PP_CpPtr< T >
• remove() : PP_List< T >, List< T >
• removeFirst() : PP_List< T >, List< T >
• removeLast() : PP_List< T >, List< T >
• removeLink() : List< T >
• replace() : PP_List< T >, List< T >
• reserve() : Vector< T >, PP_Array< T >
• reset() : ShiftIterator, SideIterator, LayoutIterator, IVSIterator, CopyIterator, BoxIterator
• resetBoxGhostBC() : DomainGhostBC
• resetConvergenceMetrics() : LevelSolver
• resize() : Vector< T >, PP_Array< T >, PP_StringRep, FluxBox, BaseFab< T >
• returnPtr() : Pool
• reverse() : MotionItem
• rewind() : PP_ListIterator< T >, ListIterator< T >
• riemann() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• rmTable() : ParmParse
• run() : AMR, Callbacks

- s -

• sameSize() : Box
• sameType() : Box
• scale() : RealVect, IntVect
• scaleAlpha() : HelmholtzOp, BaseHelmholtzOp
• scaleBeta() : HelmholtzOp, BaseHelmholtzOp
• scaleHelmCoeff() : HelmholtzOp
• secondOrderCorrection() : AMRLevelSelfGravity
• SelfGravityPhysics() : SelfGravityPhysics
• sendBoxesParallel() : BRMeshRefine
• set() : PP_Array< T >, FArrayBox, IndexType, ArrayViewData
• setall() : IndexType
• setAlpha() : HelmholtzOp
• setBdrySlopes() : PhysIBC, TestsIBC, RampIBC, CodeTestsIBC
• setBig() : Box
• setBottomSmoother() : TensorOp, PoissonOp, HelmholtzOp
• setBox() : BoxIterator
• setBoxGhostBC() : DomainGhostBC
• setBufferAllocated() : Copier
• setCodeUnits() : CodeTestsIBC
• setConvergenceMetric() : TensorOp, PoissonOp, NoOpSmoother, LevelSolver, LevelOp, LevelMG, HelmholtzOp, GSRBSmoother, BiCGStabSmoother, BaseBottomSmoother, AMRSolver, AMRLevelMG
• setCurrentBox() : PatchGodunov, GodunovPhysics
• setCurrentTime() : PatchGodunov
• setDefaultValues() : AMR, LevelSolver, LevelMG, AMRSolver, AMRLevelMG, TensorCFIVS, CFStencil, CFIVS, AMRLevelSelfGravityFactory
• setDomainGhostBC() : TensorOp, PoissonOp, HelmholtzOp, GradDivOp, BaseHelmholtzOp
• setDustCollapse() : CodeTestsIBC
• setEnableRestart() : BiCGStabSmoother
• setFalse() : BitSet
• setFortranCommon() : TestsIBC, RampIBC, CodeTestsIBC
• setFortranCommonSet() : TestsIBC, RampIBC, CodeTestsIBC
• setHelmCoeff() : HelmholtzOp
• setIndexVector() : BoxLayout
• setInhomVal() : DirichletBC, NeumannBC
• setMaxDense() : IntVectSet
• setMaxIter() : LevelSolver, BiCGStabSmoother, AMRSolver
• setMinIter() : LevelSolver, AMRSolver
• setNormType() : LevelSolver, AMRSolver
• setNumBottomGSRB() : LevelMG
• setNumSmooth() : GSRBSmoother
• setNumSmoothDown() : LevelSolver, LevelMG, AMRSolver, AMRLevelMG
• setNumSmoothUp() : LevelSolver, LevelMG, AMRSolver, AMRLevelMG
• setNumVCyclesBottom() : AMRSolver
• setOperatorTolerance() : LevelSolver, AMRSolver
• setParameters() : RefCellTagger, GaussBC
• setPeriodic() : ProblemDomain
• setPhysIBC() : GodunovPhysics
• setPressureToEntropy() : SelfGravityPhysics
• setProcID() : BoxLayout
• setRange() : Box
• setRefineGradient() : RefCellTagger
• setRefineJeans() : RefCellTagger
• setRefineOverdense() : RefCellTagger
• setRefineRegion() : RefCellTagger
• setRefineShocks() : RefCellTagger
• setRefineVorticity() : RefCellTagger
• setSmall() : Box
• setSmallPressure() : SelfGravityPhysics
• setSolverTol() : NoOpSmoother, GSRBSmoother, BiCGStabSmoother, BaseBottomSmoother
• setTanGradBC() : TensorOp, GradDivOp
• setTestProblem() : TestsIBC
• setTolerance() : LevelSolver, AMRSolver
• setToZero() : LevelFluxRegister
• setTrue() : BitSet
• setType() : IndexType
• setUnits() : SelfGravityPhysics
• setup() : Chombo::Timer, Timer
• setupForFixedHierarchyRun() : AMR
• setupForNewAMRRun() : AMR
• setupSourceTerm() : SelfGravityPhysics, AMRLevelSelfGravity
• setVal() : IVSFAB< T >, IntVect, FluxBox, BaseFab< T >
• setVector() : BoxLayoutData< T >
• setVerbose() : LevelSolver, BiCGStabSmoother, AMRSolver, IVSFAB< T >
• shift() : TreeIntVectSet, IntVectSet, IntVect, FluxBox, DenseIntVectSet, Box, BaseFab< T >
• shift_intvect() : Box
• shiftHalf() : Box, BaseFab< T >
• shiftHalf_intvect() : Box
• ShiftIterator() : ShiftIterator
• shiftIterator() : ProblemDomain
• shortside() : Box
• shrinkWrap() : PP_Array< T >
• Side() : Side
• sideEnd() : Box
• SideIterator() : SideIterator
• size() : DerivStencil, Vector< T >, NodeFArrayBox, IVSFAB< T >, Interval, FluxBox, LDOperator< T >, BoxLayout, Box, BitSet, BaseFab< T >, CArena::Node
• slopeLimiter() : GodunovUtilities
• slopes() : GodunovUtilities
• smallEnd() : Box, BaseFab< T >
• smallPressure() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• smooth() : TensorOp, PoissonOp, LevelOp, HelmholtzOp, AMRLevelMG
• solveAMR() : AMRSolver
• sort() : Vector< T >, BoxLayout
• splitBox() : BRMeshRefine
• splitTags() : BRMeshRefine
• start() : Chombo::Timer, Timer
• stateNames() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• stdVector() : Vector< T >
• step() : LevelGodunov
• stop() : Chombo::Timer, Timer
• sum() : RealVect, IntVect, FArrayBox
• sumPow() : FArrayBox
• surroundingNodes() : Box
• surroundingNodes_int() : Box
• swap() : Vector< T >, RefCountedPtr< T >, PP_Array< T >
• synchronize() : SelfGravityPhysics

- t -

• tableID() : Chombo::Timer, Timer
• tagCells() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• tagCellsInit() : AMRLevel< TTYPE >, AMRLevelSelfGravity
• tagGradient() : RefCellTagger
• tagJeans() : RefCellTagger
• tagOverdense() : RefCellTagger
• tagRegion() : RefCellTagger
• tagShocks() : RefCellTagger
• tagVorticity() : RefCellTagger
• temperature() : CodeUnits
• TenPtsGradient() : TenPtsGradient
• TensorCFInterp() : TensorCFInterp
• TensorCFIVS() : TensorCFIVS
• TensorFineStencilSet() : TensorFineStencilSet
• TensorOp() : TensorOp
• test() : IndexType
• TestsIBC() : TestsIBC
• TheCellType() : IndexType
• TheNodeType() : IndexType
• time() : AMRLevel< TTYPE >, CodeUnits
• timeEps() : AMR
• timeInterp() : PiecewiseLinearFillPatch, PiecewiseLinearFillPatchFace
• Timer() : Chombo::Timer, Timer
• TimerInit() : Chombo::Timer, Timer
• TimerSummary() : Chombo::Timer, Timer
• timeStep() : AMR
• toDouble() : PP_String
• toInteger() : PP_String
• toLong() : PP_String
• toLower() : PP_String
• toUpper() : PP_String
• transfer() : List< T >
• TreeIntVectSet() : TreeIntVectSet
• TreeIntVectSetIterator() : TreeIntVectSetIterator, TreeIntVectSet
• trueSize() : PP_Array< T >
• Tuple() : Tuple< T, N >
• TwoPtsGradient() : TwoPtsGradient
• type() : Box

- u -

• undefine() : LevelFluxRegister, BaseFab< T >
• unique() : PP_LnPtr< T >, PP_UseCount
• unpackReceivesToMe() : BoxLayoutData< T >
• unpackReceivesToMe_append() : BoxLayoutData< T >
• unset() : IndexType
• updateState() : PatchGodunov
• upSweep() : AMRLevelMG

- v -

• value() : PP_ListIterator< T >, ListIterator< T >
• vanLeerSlopes() : GodunovUtilities
• Vector() : Vector< T >
• velocity() : CodeUnits
• velocityInterval() : GodunovPhysics, SelfGravityPhysics
• verbosity() : AMRLevel< TTYPE >, AMR
• volume() : Box
• volumeOK() : Box

- w -

• Warning() : MayDay
• wc_time() : Chombo::Timer, Timer
• writeCheckpointFile() : AMR
• writePlotFile() : AMR
• writeSendDataFromMeIntoBuffers() : BoxLayoutData< T >

- ~ -

• ~AliasDataFactory() : AliasDataFactory< T >
• ~AMR() : AMR
• ~AMRLevel() : AMRLevel< TTYPE >
• ~AMRLevelFactory() : AMRLevelFactory
• ~AMRLevelMG() : AMRLevelMG
• ~AMRLevelSelfGravity() : AMRLevelSelfGravity
• ~AMRLevelSelfGravityFactory() : AMRLevelSelfGravityFactory
• ~AMRSolver() : AMRSolver
• ~Arena() : Arena
• ~ArrayViewData() : ArrayViewData
• ~BaseBottomSmoother() : BaseBottomSmoother
• ~BaseFab() : BaseFab< T >
• ~BaseHelmholtzOp() : BaseHelmholtzOp
• ~BiCGStabSmoother() : BiCGStabSmoother
• ~BitSet() : BitSet
• ~Box() : Box
• ~BoxGhostBC() : BoxGhostBC
• ~BoxIterator() : BoxIterator
• ~BoxLayout() : BoxLayout
• ~BoxLayoutData() : BoxLayoutData< T >
• ~BRMeshRefine() : BRMeshRefine
• ~CArena() : CArena
• ~CFIVS() : CFIVS
• ~CFStencil() : CFStencil
• ~CoarseAverage() : CoarseAverage
• ~CodeTestsIBC() : CodeTestsIBC
• ~CodeUnits() : CodeUnits
• ~Copier() : Copier
• ~CornerCopier() : CornerCopier
• ~DataFactory() : DataFactory< T >
• ~DataIndex() : DataIndex
• ~DerivStencil() : DerivStencil
• ~DirichletBC() : DirichletBC
• ~DisjointBoxLayout() : DisjointBoxLayout
• ~DomainGhostBC() : DomainGhostBC
• ~ExtrapBC() : ExtrapBC
• ~ExtrapFillPatch() : ExtrapFillPatch
• ~FABAliasDataFactory() : FABAliasDataFactory
• ~FArrayBox() : FArrayBox
• ~FineInterp() : FineInterp
• ~FluxBox() : FluxBox
• ~FourPtsGradient() : FourPtsGradient
• ~GaussBC() : GaussBC
• ~GodunovPhysics() : GodunovPhysics
• ~GodunovUtilities() : GodunovUtilities
• ~GradDivOp() : GradDivOp
• ~Gradient() : Gradient
• ~GSRBSmoother() : GSRBSmoother
• ~HelmholtzOp() : HelmholtzOp
• ~HOExtrapBC() : HOExtrapBC
• ~IntVect() : IntVect
• ~IntVectSet() : IntVectSet
• ~IVSFAB() : IVSFAB< T >
• ~IVSIterator() : IVSIterator
• ~LayoutData() : LayoutData< T >
• ~LayoutIndex() : LayoutIndex
• ~LayoutIterator() : LayoutIterator
• ~LDOperator() : LDOperator< T >
• ~LevelData() : LevelData< T >
• ~LevelFluxRegister() : LevelFluxRegister
• ~LevelGodunov() : LevelGodunov
• ~LevelMG() : LevelMG
• ~LevelOp() : LevelOp
• ~LevelSolver() : LevelSolver
• ~List() : List< T >
• ~MergeBoxesOnLines() : MergeBoxesOnLines
• ~MeshRefine() : MeshRefine
• ~MGInterp() : MGInterp
• ~NeumannBC() : NeumannBC
• ~NodeFArrayBox() : NodeFArrayBox
• ~NoOpSmoother() : NoOpSmoother
• ~ParmParse() : ParmParse
• ~PatchGodunov() : PatchGodunov
• ~PhysIBC() : PhysIBC
• ~PiecewiseLinearFillPatch() : PiecewiseLinearFillPatch
• ~PiecewiseLinearFillPatchFace() : PiecewiseLinearFillPatchFace
• ~PoissonOp() : PoissonOp
• ~Pool() : Pool
• ~PP_Array() : PP_Array< T >
• ~PP_CpPtr() : PP_CpPtr< T >
• ~PP_List() : PP_List< T >
• ~PP_LnPtr() : PP_LnPtr< T >
• ~PP_StringRep() : PP_StringRep
• ~PP_UseCount() : PP_UseCount
• ~QuadCFInterp() : QuadCFInterp
• ~QuadCFStencil() : QuadCFStencil
• ~RampIBC() : RampIBC
• ~RefCellTagger() : RefCellTagger
• ~RefCountedPtr() : RefCountedPtr< T >
• ~SelfGravityPhysics() : SelfGravityPhysics
• ~ShiftIterator() : ShiftIterator
• ~Side() : Side
• ~SideIterator() : SideIterator
• ~TenPtsGradient() : TenPtsGradient
• ~TensorCFInterp() : TensorCFInterp
• ~TensorCFIVS() : TensorCFIVS
• ~TensorFineStencilSet() : TensorFineStencilSet
• ~TensorOp() : TensorOp
• ~TestsIBC() : TestsIBC
• ~Timer() : Chombo::Timer, Timer
• ~TreeIntVectSet() : TreeIntVectSet
• ~TwoPtsGradient() : TwoPtsGradient
• ~Vector() : Vector< T >

---